Madison Beer nació el 5 de marzo de 1999 en Jericho, Long Island, Nueva York. Es hija de Robert Beer, un constructor de casas de lujo, y de Tracie Beer, diseñadora de interiores. Tiene un hermano menor, Ryder.​ Sus padres están divorciados y su padre Robert volvió a casarse. Beer estudió en Jericho Middle School hasta que en 2012 continuó sus estudios desde casa. Trabajó como artista independiente los últimos años, y a mediados de este año consiguió aliarse a una discográfica, Epic Records. Madison es judía de ascendencia asquenazí.